亞東醫院核心基因定序系統運用微軟 Azure 在臺資料中心算力推進精準醫療

亞東醫院與台灣微軟、亞大基因科技合作，在 Azure 台灣區域建置核心基因定序雲端系統，利用雲端可彈性擴充的算力與自動化機制，加速推進精準化醫療與臨床研究。

現今各行各業都想運用 AI 提升營運或是研究效能，然而自行建置高算力的自有運算中心並非所有企業都能負擔，而且有些研究或計畫需求可能需要短期的算力需求，隨需求而改變的雲端算力可能更為合適。此外，不同行業將資料上雲端也有不同法規需要遵循，尤其像醫療、金融等較多機敏資料的行業，法規更為嚴謹。

亞東紀念醫院副院長張至宏

亞東紀念醫院完成核心基因定序雲端系統建置，打造亞東精準醫療永續平台

亞東紀念醫院宣布與台灣微軟、亞大基因科技（ATGENOMIX）共同合作，完成核心基因定序雲端系統建置，打造「亞東精準醫療永續平台」，加速精準化醫療與臨床研究，成為臺灣首家將核心基因定序系統導入雲端的醫學中心。系統運用微軟 Azure 台灣區域，透過可彈性擴充的算力與自動化機制，在安全、合規且低延遲的雲原生環境下，加速對基因定序資料分析，協助院方逐步強化基因變異高風險族群的辨識與健康管理，可在健康、亞健康到發病等不同階段提供臨床參考，以支援早期預警與適時介入，降低疾病風險的可能性。

台灣微軟公共業務事業群健康與醫療產業總監劉致宏

隨著衛福部健保署自 2024 年將次世代基因定序（NGS）檢測納入健保給付後，臺灣在精準醫療進展更快，預估每年約二萬多名癌友受惠。透過 NGS 檢測，醫師得以及早篩檢與追蹤，並依個別基因變異制定個人化治療與用藥策略，達到對症下藥、穩定病情，進一步提升存活率。要實現精準檢測與治療，關鍵便在於基因定序技術，即將 DNA 轉換成可分析的資訊，找出與疾病相關的基因變異。不過一次完整定序產生的資料量約 100GB，須仰賴龐大且複雜的資料處理、轉換與查詢流程，才能萃取臨床決策所需的關鍵資訊。

亞東紀念醫院醫學研究部主任吳彥雯

亞東醫院作為新北市主要醫學中心，長期投入基因定序與精準醫療的臨床實證與研究，並作為未來醫療服務的核心方向。其醫學研究部自兩年前展開規劃與建置大型基因資料庫，累積逾一萬名受檢者的基因定序資料，並在院內啟動「精準醫療計畫」，推動在各科室的應用發展。

亞大基因科技執行長暨創辦人張明台

為提升分析效率與應用靈活性，亞東醫院特別與基因大數據與生物醫學資訊科技新創的亞大基因科技合作，運用其 Bio-IT 雲端平台服務 Atgenomix Seqslab 打造自有的基因定序雲端系統，並運用建構於 Microsoft Azure 雲端平台，以其彈性擴充的算力與自動化流程，讓系統得以快速處理巨量基因資料，進一步加速個人化精準醫療與臨床研究的實踐。

基因定序系統採用多項 Azure 服務，包括 Azure Data Lake Storage Gen2、Azure Database for MySQL、AKS、Azure Container Services、Azure Batch 等，系統更通過 ISO 27001、27018、13485、62304 等多項國際資安與醫療軟體認證，強化資料治理與安全性。

為蒐集與分析基因資料，亞東醫院建置並持續更新基因資料庫，每季或每半年可以上傳上百位受檢者定序資料並統一安全儲存於 Azure Data Lake 中。每位受檢者約含有 70 萬個基因變異點，資料總量可觀，將作為後續分析或研究基礎。

亞東紀念醫院與亞大基因合作驅動精準醫療

因應日益龐大的資料規模並強化分析效率，系統更整合 GPU 加速 NVIDIA Parabricks 基因體分析套件，以提升效能，例如在 30 倍深度的全基因定序（WGS）的變異點偵測中，透過 80 台搭載 NVIDIA T4 GPU 的 Azure NC8as_T4_v3 虛擬機，較傳統在 64 核心處理器上執行，可大幅縮短分析處理時間，從原本約 4 小時縮減至僅需 10 分鐘。針對大規模資料處理，如 2,500 名受檢者的全基因體定型（WGG）聯合分析，亦可在 40 小時內完成，而傳統方法需一個月，效率提升達 16 倍，協助研究人員與臨床醫師更快取得關鍵資料。

為了支援即時的互動式分析與快速臨床決策，系統亦強化SQL 查詢效能，運用雲端平臺的高效運算與高速儲存，系統可對涵蓋逾一萬名受試者、總計達 90 億筆變異資料的資料（Data Lakehouse）進行快速查詢。平均查詢時間由 140 秒縮短至約 12 秒，以每月處理約 1,000 筆查詢為例，可協助臨床醫師節省數十小時，大幅提升基因檢測與決策效率。

隨著政策鬆綁與科技革新，近年來臺灣醫療機構已加速將電子病歷及相關服務上雲。亞東醫院身為醫學中心，除持續推動 IT 現代化，亦將基因定序雲端系統部署至微軟在臺區域資料中心，其資料均留存於境內，符合醫療法規與資安標準，也因就近調度雲端運算資源，有效降低資料傳輸延遲、縮短分析前置時間，實現更快速地啟動分析與查詢。在微軟的低延遲、安全合規且高效雲端服務下，亞東醫院得以在安全信任的基礎上，加速推動基因定序的臨床實證與應用擴展。

亞東醫院目前已將基因定序系統應用於心血管疾病、神經系統疾病、罕見疾病等遺傳性疾病相關研究，協助識別潛在高風險族群，並提供臨床專科醫師作為是否召回、定期追蹤與精準健康管理的參考。同時配合國家的生物資料庫計畫，與癌症照護團隊密切合作，布望利用此系統協助特定疾病管理，後續也將擴展至腸道菌基因與失智症關聯研究等領域。